В лечебных целях применяют исключительно листья туи  (молодые побеги). Туя содержит эфирные масла, танины, туевую кислоту, витамин С. Заготавливают молодые побеги туи в мае-июне. Препараты из туи стимулируют нервную систему, работу сердечной мышцы, способствуя более эффективным ее сокращениям, уничтожают кишечных паразитов, вызывают сокращение матки, при приеме внутрь препятствуют всасыванию железа и других минералов.

    10-процентная мазь из свежих побегов туи применяется наружно как противовоспалительное и противоревматическое средство, для выведения бородавок; 40-процентный настой из свежих побегов назначают при лечении кожных проявлений красной волчанки. Требуется осторожность в больших концентрациях туя вызывает раздражение кожи вплоть до образования пузырей. Наружно для обмываний кожи употребляют настой туи (1 столовую ложку свежих побегов туи настаивают 20 минут в 1/2 стакана кипятка, процеживают).

     В народной медицине настой свежих побегов туи принимают внутрь для лечения почечно- и желчекаменной болезней, при других заболеваниях печени, почек, мочевого пузыря, при подагре, ревматизме, водянке. Чай готовят так: 20 г свежих побегов туи настаивают в 3 л кипятка, процеживают. Принимают по 1 стакану 3 раза в день. Побеги туи можно комбинировать с листьями толокнянки, травой грыжника, березовыми почками.

     При воспалении печени пользуются отваром побегов туи. Готовят его так: 1 столовую ложку сухого измельченного сырья кипятят 15 минут в стакане воды, затем процеживают и доводят объем до первоначального. Принимают по 1/4 стакана 3 раза в день до еды. Аналогично готовят отвар для лечения уретритов, циститов и нефрозов. В этом случае отвар выпивают в течение дня за 30 минут до еды.

      При аденоме предстательной железы также пользуются отваром побегов туи. Его пьют по 1/3 стакана 3 раза в день за 30 минут до еды.

      Отвар побегов туи для лечения аллергического диатеза готовят несколько иначе. 1 чайную ложку сухого измельченного сырья кипятят 15 минут в стакане воды, затем процеживают и доводят объем до первоначального кипяченой водой. Выпивают за день за 30 минут до еды.

     Для рассасывания спаек и рубцов при новообразованиях применяют настойку побегов туи: 20 г измельченного сырья заливают 1 стаканом 70%-ного спирта, настаивают в течение недели, а затем процеживают. Принимают по 10-15 капель 3-4 раза в день.

      При остеохондрозе и артрите помогает отвар побегов туи: 1 столовую ложку сухого измельченного сырья кипятят 15 минут в стакане воды, затем процеживают и доводят объем до первоначального кипяченой водой. Принимают по 1/3 стакана 3 раза в день за 40 минут до еды.

      При сикозе, красной волчанке, сухих мозолях пользуются настойкой побегов туи, смешанной с равным количеством вазелина для получения мази, которой обрабатывают пораженные участки кожи.

     Ни в коем случае нельзя применять внутрь препараты туи во время беременности, поскольку они провоцируют выкидыш. Не рекомендуется применение при кормлении ребенка грудью.